Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Syf2Q9D198 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Syf2Q9D198 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms