Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Wdr55Q9CX97 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Wdr55Q9CX97 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Wdr55Q9CX97 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Wdr55Q9CX97 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Wdr55Q9CX97 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Wdr55Q9CX97 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Wdr55Q9CX97 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Wdr55Q9CX97 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Wdr55Q9CX97 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Wdr55Q9CX97 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Wdr55Q9CX97 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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