Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms