Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot11Q9CWN7 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms