Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Pgpep1lQ9CWB5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Pgpep1lQ9CWB5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Pgpep1lQ9CWB5 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Pgpep1lQ9CWB5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Pgpep1lQ9CWB5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Pgpep1lQ9CWB5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Pgpep1lQ9CWB5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Pgpep1lQ9CWB5 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Pgpep1lQ9CWB5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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