Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atxn3Q9CVD2 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Atxn3Q9CVD2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Atxn3Q9CVD2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Atxn3Q9CVD2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atxn3Q9CVD2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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