Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms