Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufb9Q9CQJ8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms