Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ssxb1Q9CPU1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssxb1Q9CPU1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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