Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Sike1Q9CPR7 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Sike1Q9CPR7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sike1Q9CPR7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sike1Q9CPR7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sike1Q9CPR7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Sike1Q9CPR7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sike1Q9CPR7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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