Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim26Q99PN3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim26Q99PN3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms