Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup155Q99P88 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms