Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Prl3a1-201ENSMUST00000049463 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rtn4Q99P72 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 AC158631.2-201ENSMUST00000219999 478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtn4Q99P72 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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