Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tdrd1Q99MV1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms