Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gdpd3Q99LY2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms