Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp16Q99LG0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp16Q99LG0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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