Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Higd1bQ99JY6 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms