Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tspan1Q99J59 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms