Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trim59Q922Y2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trim59Q922Y2 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms