Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atl3Q91YH5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atl3Q91YH5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atl3Q91YH5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atl3Q91YH5 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atl3Q91YH5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Atl3Q91YH5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atl3Q91YH5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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