Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx15Q91WE1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx15Q91WE1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx15Q91WE1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx15Q91WE1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx15Q91WE1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx15Q91WE1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Snx15Q91WE1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx15Q91WE1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Snx15Q91WE1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Snx15Q91WE1 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Snx15Q91WE1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Snx15Q91WE1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Snx15Q91WE1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms