Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Klhdc3Q8VEM9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Klhdc3Q8VEM9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Klhdc3Q8VEM9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Klhdc3Q8VEM9 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Klhdc3Q8VEM9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Klhdc3Q8VEM9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Klhdc3Q8VEM9 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
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Klhdc3Q8VEM9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Klhdc3Q8VEM9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Klhdc3Q8VEM9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Klhdc3Q8VEM9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms