Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Srsf4Q8VE97 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms