Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 565.3 ms