Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rdh10Q8VCH7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rdh10Q8VCH7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rdh10Q8VCH7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rdh10Q8VCH7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rdh10Q8VCH7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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Rdh10Q8VCH7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh10Q8VCH7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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