Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim68Q8K243 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms