Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Hpf1Q8CFE2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hpf1Q8CFE2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms