Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snx8Q8CFD4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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