Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Pramef8Q8CE24 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef8Q8CE24 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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