Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SynpoQ8CC35 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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