Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ccdc113Q8C5T8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms