Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ssuh2Q8C3L1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ssuh2Q8C3L1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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