Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm13207-201ENSMUST00000119862 773 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Prl2a1-201ENSMUST00000023602 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Olfr380-203ENSMUST00000127789 1536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trim35Q8C006 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Zfp616-203ENSMUST00000116546 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Ang-202ENSMUST00000171688 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Trim35Q8C006 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms