Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube3dQ8BX13 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube3dQ8BX13 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Ube3dQ8BX13 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ube3dQ8BX13 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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