Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ssc5dQ8BV57 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ssc5dQ8BV57 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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