Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6bQ8BKI2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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