Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gabra5Q8BHJ7 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms