Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
ChfrQ810L3 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ChfrQ810L3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms