Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrfn4Q80XU8 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Lrfn4Q80XU8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Lrfn4Q80XU8 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrfn4Q80XU8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms