Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SnupnQ80W37 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SnupnQ80W37 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms