Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Dsg1bQ7TSF1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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