Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ckap2lQ7TS74 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms