Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trak1Q6PD31 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trak1Q6PD31 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms