Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Zbtb40Q6PCS8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Zbtb40Q6PCS8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms