Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Usp49Q6P9L4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp49Q6P9L4 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp49Q6P9L4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp49Q6P9L4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Usp49Q6P9L4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Usp49Q6P9L4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp49Q6P9L4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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