Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tpm4Q6IRU2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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