Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pdzrn3Q69ZS0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pdzrn3Q69ZS0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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