Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Jmjd1cQ69ZK6 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms