Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prex1Q69ZK0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms