Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CltcQ68FD5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CltcQ68FD5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms